Deixar sua casa para uma nova vida em uma Megalópole como um estudante universitário é um sonho que se torna realidade para Naoki (ou Rina, se o jogador decidir jogar o jogo como uma menina). No entanto, o sonho logo se transforma em pesadelo quando um terremoto atinge e destrói a cidade, deixando Naoki / Rina preso em um túnel. Agora eles devem sobreviver à catástrofe usando inteligência, destreza física e sorte, resgatar outros sobreviventes presos nos escombros e correr para encontrar reforços ou qualquer tipo de ajuda. Durante o jogo, o jogador consegue interagir com suas duas companheiras, a relação entre elas afetando o final. Hazuki é mantida sob a mira de uma arma na beira de um arranha-céu por seu meio-irmão, Yoichi, enquanto ele revela seu plano de vingança pelo assassinato de sua amada filha. Ele então é atacado pelo jogador enquanto Saki o distrai. O prédio é repentinamente atingido por ondas, fazendo com que Hazuki perca o equilíbrio. O jogador pode então optar por salvá-la ou deixá-la morrer.