Spider-Man Web of Shadows é um videogame de ação e aventura em terceira pessoa , ambientado em um mundo aberto que lembra Manhattan . A jogabilidade é muito semelhante aos títulos anteriores do Homem-Aranha ( Homem-Aranha 2 , Homem-Aranha 3 e Último Homem-Aranha) Os jogadores assumem o papel de Homem-Aranha e podem balançar a teia, zipar com a teia, rastejar pelas paredes e usar o ‘sentido de aranha’ para identificar e travar os inimigos. O combate melhora em relação aos jogos anteriores e agora ocorre no solo, nas paredes e no ar, devido à introdução de novos tipos de inimigos, que podem voar ou grudar nas superfícies. O jogo também introduz o “ataque da teia”, uma mecânica de jogo onde o Homem-Aranha anexa uma teia ao inimigo mais próximo e se puxa até ele; isso serve como base para o combate aéreo, mas também pode ser usado no solo e em outras superfícies.

Embora a história principal do jogo seja linear, há vários eventos aleatórios ocorrendo constantemente no mapa do jogo, como lutas entre gangues ou, em estágios posteriores da história, ninhos de simbionte que precisam ser destruídos. Eles são totalmente opcionais, mas se o jogador decidir intervir, eles o recompensam com XP . Existem também inúmeros desafios, como derrotar um determinado número de inimigos ou coletar amostras de simbiontes e itens colecionáveis, que recompensam o jogador também com XP e aumentam sua barra de saúde e velocidade de giro na teia.